Marié à Olena Kiyachko, qu'il a rencontrée à l’université il est père de deux enfants : Oleksandra (2004) et Kyrylo (2013) baptisés selon le rite de l'Église orthodoxe.
Étant lui-même juif non pratiquant et n'ayant reçu aucune éducation religieuse, il se considère comme laïc et affirme que sa religion est « une affaire privée » dont il ne souhaite pas faire étalage Il déclare à propos de ses origines : « Le fait que je sois juif se classe seulement en 20e position dans ma longue liste de défauts » En 2022, lors de l'invasion de l'Ukraine par la Russie, Zelensky sort de sa réserve et met en avant ses origines juives pour contrer les accusations de nazisme de la part de Vladimir Poutine et obtenir les soutiens d'Israël et de la diaspora juive
Sa langue maternelle est le russe, mais il parle couramment l'ukrainien et l'anglais